Possédant des écosystèmes similaires, ils forment à eux deux ce que l’on appelle le centre du parc National des Raja Ampat. Il est plus peuplé, et reçoit un nombre croissant de visiteurs. Leur choix oscille entre homestay locaux rudimentaires, resort de luxe, et bateaux de croisière. Le port de Waisai, accessible par ferry, se développe petit a petit. Il possède déjà un aéroport dont le trafic reste très limitée.
Le Détroit de Dampier, est délimité par l’île de Batanta au sud, et par l’île de Waigeo au Nord. Au milieu du détroit se situent les îles les plus populaires de Kri, Gam et Mansuar. Peu profond, il est exposé aux courants qui lui garantissent une vie marine riche, et des coraux en bonne santé.
Île située dans l’archipel de Gam, Penemu (ou « Piaynemo » en langage local) possède une forme étrange dessinée par des baies et des lagons intérieurs. Possédant de belles plages, elle est surtout connue pour ses nombreux rochers calcaires en forme de pains de sucre. Penemu s’enorgueillit également de fonds sous-marins magnifiques.